Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ephb4P54761 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ephb4P54761 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ephb4P54761 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ephb4P54761 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ephb4P54761 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms