Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa13P50711 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Defa13P50711 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa13P50711 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16,55■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa13P50711 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa13P50711 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,52■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16,52■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16,52■□□□□ 0,24
Defa13P50711 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,52■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,52■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
Defa13P50711 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16,48■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,47■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Defa13P50711 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms