Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TspoP50637 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TspoP50637 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TspoP50637 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TspoP50637 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TspoP50637 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TspoP50637 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TspoP50637 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TspoP50637 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TspoP50637 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TspoP50637 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TspoP50637 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TspoP50637 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TspoP50637 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TspoP50637 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TspoP50637 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TspoP50637 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TspoP50637 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TspoP50637 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TspoP50637 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TspoP50637 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TspoP50637 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TspoP50637 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TspoP50637 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TspoP50637 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TspoP50637 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TspoP50637 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TspoP50637 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TspoP50637 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TspoP50637 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TspoP50637 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TspoP50637 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TspoP50637 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TspoP50637 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TspoP50637 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TspoP50637 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TspoP50637 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TspoP50637 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TspoP50637 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TspoP50637 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TspoP50637 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TspoP50637 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TspoP50637 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TspoP50637 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TspoP50637 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TspoP50637 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TspoP50637 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TspoP50637 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TspoP50637 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TspoP50637 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TspoP50637 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TspoP50637 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TspoP50637 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TspoP50637 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TspoP50637 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TspoP50637 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TspoP50637 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TspoP50637 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TspoP50637 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TspoP50637 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TspoP50637 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TspoP50637 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TspoP50637 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TspoP50637 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TspoP50637 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TspoP50637 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TspoP50637 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TspoP50637 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TspoP50637 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TspoP50637 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TspoP50637 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TspoP50637 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TspoP50637 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TspoP50637 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TspoP50637 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TspoP50637 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TspoP50637 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TspoP50637 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TspoP50637 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TspoP50637 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TspoP50637 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TspoP50637 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TspoP50637 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TspoP50637 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TspoP50637 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TspoP50637 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TspoP50637 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TspoP50637 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TspoP50637 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TspoP50637 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TspoP50637 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TspoP50637 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TspoP50637 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TspoP50637 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TspoP50637 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TspoP50637 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TspoP50637 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TspoP50637 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TspoP50637 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TspoP50637 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms