Protein–RNA interactions for Protein: P49722

Psma2, Proteasome subunit alpha type-2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma2P49722 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psma2P49722 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psma2P49722 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psma2P49722 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psma2P49722 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psma2P49722 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psma2P49722 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psma2P49722 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psma2P49722 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psma2P49722 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psma2P49722 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma2P49722 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psma2P49722 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psma2P49722 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psma2P49722 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psma2P49722 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psma2P49722 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psma2P49722 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma2P49722 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma2P49722 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma2P49722 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psma2P49722 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma2P49722 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma2P49722 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms