Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
PtpreP49446 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25,94■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
PtpreP49446 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25,92■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
PtpreP49446 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25,88■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,87■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,85■■□□□ 1,73
PtpreP49446 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
PtpreP49446 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25,83■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
PtpreP49446 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
PtpreP49446 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25,81■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
PtpreP49446 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25,77■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,72
PtpreP49446 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25,76■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
PtpreP49446 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
PtpreP49446 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
PtpreP49446 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
PtpreP49446 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25,67■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
PtpreP49446 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,65■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
PtpreP49446 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
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