Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HpdP49429 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HpdP49429 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HpdP49429 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HpdP49429 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HpdP49429 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HpdP49429 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HpdP49429 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HpdP49429 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HpdP49429 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HpdP49429 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HpdP49429 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HpdP49429 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HpdP49429 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HpdP49429 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HpdP49429 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HpdP49429 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HpdP49429 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HpdP49429 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HpdP49429 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HpdP49429 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HpdP49429 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HpdP49429 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HpdP49429 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HpdP49429 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HpdP49429 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HpdP49429 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HpdP49429 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HpdP49429 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HpdP49429 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HpdP49429 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HpdP49429 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HpdP49429 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HpdP49429 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HpdP49429 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HpdP49429 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HpdP49429 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HpdP49429 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HpdP49429 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HpdP49429 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HpdP49429 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HpdP49429 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HpdP49429 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HpdP49429 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HpdP49429 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HpdP49429 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HpdP49429 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HpdP49429 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HpdP49429 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HpdP49429 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HpdP49429 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HpdP49429 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HpdP49429 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HpdP49429 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HpdP49429 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HpdP49429 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HpdP49429 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HpdP49429 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HpdP49429 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HpdP49429 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HpdP49429 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HpdP49429 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HpdP49429 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HpdP49429 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HpdP49429 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HpdP49429 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HpdP49429 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HpdP49429 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HpdP49429 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HpdP49429 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HpdP49429 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HpdP49429 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HpdP49429 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HpdP49429 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HpdP49429 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HpdP49429 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HpdP49429 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HpdP49429 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HpdP49429 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HpdP49429 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HpdP49429 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HpdP49429 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HpdP49429 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HpdP49429 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HpdP49429 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HpdP49429 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HpdP49429 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HpdP49429 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HpdP49429 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms