Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rfx1P48377 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rfx1P48377 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx1P48377 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rfx1P48377 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms