Protein–RNA interactions for Protein: P47856

Gfpt1, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfpt1P47856 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gfpt1P47856 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gfpt1P47856 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gfpt1P47856 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gfpt1P47856 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gfpt1P47856 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms