Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfsf4P43488 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf4P43488 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf4P43488 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf4P43488 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms