Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr2f2P43135 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2f2P43135 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2f2P43135 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nr2f2P43135 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr2f2P43135 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms