Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppm1bP36993 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppm1bP36993 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppm1bP36993 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppm1bP36993 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms