Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Flt1P35969 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Flt1P35969 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Flt1P35969 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Flt1P35969 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Flt1P35969 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Flt1P35969 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Flt1P35969 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Flt1P35969 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Flt1P35969 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Flt1P35969 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Flt1P35969 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Flt1P35969 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Flt1P35969 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Flt1P35969 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Flt1P35969 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Flt1P35969 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Flt1P35969 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms