Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Ddit3P35639 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddit3P35639 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddit3P35639 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ddit3P35639 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ddit3P35639 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ddit3P35639 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddit3P35639 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddit3P35639 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddit3P35639 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddit3P35639 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ddit3P35639 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddit3P35639 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddit3P35639 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddit3P35639 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddit3P35639 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddit3P35639 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ddit3P35639 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ddit3P35639 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddit3P35639 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ddit3P35639 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ddit3P35639 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddit3P35639 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddit3P35639 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms