Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdha1P35486 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdha1P35486 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdha1P35486 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdha1P35486 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdha1P35486 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdha1P35486 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdha1P35486 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdha1P35486 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdha1P35486 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdha1P35486 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdha1P35486 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdha1P35486 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms