Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cd22P35329 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cd22P35329 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cd22P35329 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cd22P35329 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cd22P35329 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cd22P35329 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cd22P35329 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd22P35329 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cd22P35329 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd22P35329 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cd22P35329 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cd22P35329 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd22P35329 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd22P35329 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms