Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp12P34960 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp12P34960 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mmp12P34960 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mmp12P34960 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms