Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola2P33611 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola2P33611 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola2P33611 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola2P33611 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola2P33611 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola2P33611 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pola2P33611 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pola2P33611 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pola2P33611 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola2P33611 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola2P33611 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola2P33611 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pola2P33611 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pola2P33611 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pola2P33611 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola2P33611 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola2P33611 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pola2P33611 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pola2P33611 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola2P33611 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola2P33611 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pola2P33611 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pola2P33611 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms