Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Cdh15P33146 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Cdh15P33146 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Cdh15P33146 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Cdh15P33146 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Cdh15P33146 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Cdh15P33146 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25,84■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Cdh15P33146 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Cdh15P33146 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Cdh15P33146 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Cdh15P33146 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms