Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chrm4P32211 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrm4P32211 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrm4P32211 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrm4P32211 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms