Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd28P31041 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd28P31041 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd28P31041 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd28P31041 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd28P31041 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd28P31041 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd28P31041 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd28P31041 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd28P31041 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd28P31041 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd28P31041 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd28P31041 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd28P31041 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd28P31041 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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