Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk4P30285 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk4P30285 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk4P30285 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms