Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccnd3P30282 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccnd3P30282 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccnd3P30282 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccnd3P30282 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnd3P30282 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnd3P30282 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnd3P30282 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccnd3P30282 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccnd3P30282 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccnd3P30282 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccnd3P30282 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccnd3P30282 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccnd3P30282 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccnd3P30282 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccnd3P30282 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccnd3P30282 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccnd3P30282 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms