Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mep1aP28825 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mep1aP28825 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mep1aP28825 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms