Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Marcksl1P28667 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Marcksl1P28667 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Marcksl1P28667 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Marcksl1P28667 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Marcksl1P28667 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms