Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd9P28357 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd9P28357 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd9P28357 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd9P28357 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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