Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,33■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16,32■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,31■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16,3■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa3P28310 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa3P28310 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa3P28310 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa3P28310 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16,21■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa3P28310 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa3P28310 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defa3P28310 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,4 ms