Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjc1P28229 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gjc1P28229 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjc1P28229 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjc1P28229 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjc1P28229 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.1 ms