Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-DMaP28078 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-DMaP28078 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-DMaP28078 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms