Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ChgaP26339 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ChgaP26339 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ChgaP26339 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ChgaP26339 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ChgaP26339 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ChgaP26339 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ChgaP26339 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ChgaP26339 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ChgaP26339 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ChgaP26339 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ChgaP26339 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ChgaP26339 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ChgaP26339 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ChgaP26339 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ChgaP26339 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ChgaP26339 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ChgaP26339 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ChgaP26339 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ChgaP26339 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ChgaP26339 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ChgaP26339 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ChgaP26339 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms