Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nfkb1P25799 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfkb1P25799 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfkb1P25799 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.2 ms