Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pax3P24610 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pax3P24610 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pax3P24610 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax3P24610 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pax3P24610 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pax3P24610 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pax3P24610 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pax3P24610 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pax3P24610 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pax3P24610 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pax3P24610 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pax3P24610 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms