Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd247P24161 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd247P24161 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd247P24161 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd247P24161 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd247P24161 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd247P24161 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cd247P24161 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd247P24161 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd247P24161 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd247P24161 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd247P24161 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd247P24161 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd247P24161 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd247P24161 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd247P24161 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd247P24161 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd247P24161 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd247P24161 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd247P24161 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd247P24161 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd247P24161 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd247P24161 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms