Protein–RNA interactions for Protein: P23881

Tcea3, Transcription elongation factor A protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea3P23881 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcea3P23881 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcea3P23881 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea3P23881 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcea3P23881 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms