Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkchP23298 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkchP23298 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkchP23298 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkchP23298 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkchP23298 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkchP23298 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkchP23298 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrkchP23298 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrkchP23298 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkchP23298 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkchP23298 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkchP23298 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkchP23298 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkchP23298 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkchP23298 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkchP23298 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms