Protein–RNA interactions for Protein: P22682

Cbl, E3 ubiquitin-protein ligase CBL, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CblP22682 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CblP22682 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CblP22682 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CblP22682 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CblP22682 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CblP22682 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CblP22682 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CblP22682 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CblP22682 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CblP22682 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CblP22682 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CblP22682 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CblP22682 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CblP22682 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CblP22682 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CblP22682 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CblP22682 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CblP22682 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CblP22682 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CblP22682 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CblP22682 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CblP22682 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CblP22682 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CblP22682 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CblP22682 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CblP22682 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CblP22682 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CblP22682 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CblP22682 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CblP22682 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CblP22682 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CblP22682 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CblP22682 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CblP22682 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CblP22682 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CblP22682 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CblP22682 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CblP22682 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CblP22682 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CblP22682 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CblP22682 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CblP22682 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CblP22682 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CblP22682 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CblP22682 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CblP22682 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CblP22682 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CblP22682 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CblP22682 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CblP22682 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CblP22682 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CblP22682 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CblP22682 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CblP22682 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CblP22682 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CblP22682 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CblP22682 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CblP22682 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CblP22682 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CblP22682 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CblP22682 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CblP22682 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CblP22682 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CblP22682 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CblP22682 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CblP22682 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CblP22682 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CblP22682 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CblP22682 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CblP22682 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CblP22682 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CblP22682 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CblP22682 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CblP22682 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CblP22682 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CblP22682 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CblP22682 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CblP22682 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CblP22682 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CblP22682 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CblP22682 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CblP22682 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CblP22682 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CblP22682 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CblP22682 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CblP22682 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CblP22682 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CblP22682 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CblP22682 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CblP22682 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CblP22682 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CblP22682 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CblP22682 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CblP22682 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CblP22682 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CblP22682 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CblP22682 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CblP22682 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CblP22682 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CblP22682 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms