Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RarbP22605 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RarbP22605 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RarbP22605 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RarbP22605 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RarbP22605 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RarbP22605 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RarbP22605 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RarbP22605 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RarbP22605 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RarbP22605 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RarbP22605 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RarbP22605 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RarbP22605 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RarbP22605 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RarbP22605 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RarbP22605 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RarbP22605 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RarbP22605 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RarbP22605 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RarbP22605 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RarbP22605 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RarbP22605 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RarbP22605 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RarbP22605 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RarbP22605 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RarbP22605 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RarbP22605 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RarbP22605 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RarbP22605 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RarbP22605 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RarbP22605 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RarbP22605 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RarbP22605 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RarbP22605 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RarbP22605 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RarbP22605 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RarbP22605 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RarbP22605 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RarbP22605 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RarbP22605 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RarbP22605 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RarbP22605 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RarbP22605 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RarbP22605 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RarbP22605 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RarbP22605 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RarbP22605 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RarbP22605 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RarbP22605 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RarbP22605 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RarbP22605 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RarbP22605 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RarbP22605 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RarbP22605 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RarbP22605 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RarbP22605 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RarbP22605 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RarbP22605 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RarbP22605 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RarbP22605 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RarbP22605 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RarbP22605 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RarbP22605 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RarbP22605 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RarbP22605 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RarbP22605 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RarbP22605 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RarbP22605 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RarbP22605 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RarbP22605 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RarbP22605 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RarbP22605 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RarbP22605 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RarbP22605 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RarbP22605 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RarbP22605 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RarbP22605 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RarbP22605 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RarbP22605 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RarbP22605 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RarbP22605 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RarbP22605 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RarbP22605 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RarbP22605 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RarbP22605 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RarbP22605 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RarbP22605 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RarbP22605 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RarbP22605 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RarbP22605 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RarbP22605 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RarbP22605 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RarbP22605 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RarbP22605 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RarbP22605 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RarbP22605 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RarbP22605 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RarbP22605 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RarbP22605 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms