Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Edn1P22387 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edn1P22387 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edn1P22387 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edn1P22387 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edn1P22387 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Edn1P22387 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Edn1P22387 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn1P22387 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn1P22387 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edn1P22387 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edn1P22387 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn1P22387 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edn1P22387 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edn1P22387 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms