Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22,18■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Bmp4P21275 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22,14■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22,14■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22,1■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22,08■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Bmp4P21275 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22,02■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Bmp4P21275 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Bmp4P21275 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Bmp4P21275 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22,01■■□□□ 1,11
Bmp4P21275 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Bmp4P21275 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Bmp4P21275 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
Bmp4P21275 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
Bmp4P21275 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Bmp4P21275 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Bmp4P21275 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Bmp4P21275 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,1 ms