Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChrneP20782 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChrneP20782 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChrneP20782 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChrneP20782 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChrneP20782 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChrneP20782 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChrneP20782 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChrneP20782 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChrneP20782 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChrneP20782 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChrneP20782 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChrneP20782 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChrneP20782 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ChrneP20782 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ChrneP20782 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms