Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms