Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfeP19426 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfeP19426 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NelfeP19426 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NelfeP19426 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NelfeP19426 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NelfeP19426 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NelfeP19426 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NelfeP19426 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NelfeP19426 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NelfeP19426 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NelfeP19426 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NelfeP19426 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NelfeP19426 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfeP19426 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfeP19426 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NelfeP19426 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms