Protein–RNA interactions for Protein: P16301

Lcat, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcatP16301 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LcatP16301 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LcatP16301 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LcatP16301 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LcatP16301 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LcatP16301 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LcatP16301 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LcatP16301 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LcatP16301 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LcatP16301 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LcatP16301 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LcatP16301 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LcatP16301 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LcatP16301 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LcatP16301 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LcatP16301 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LcatP16301 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LcatP16301 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LcatP16301 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LcatP16301 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LcatP16301 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LcatP16301 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LcatP16301 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LcatP16301 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LcatP16301 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LcatP16301 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LcatP16301 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LcatP16301 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LcatP16301 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LcatP16301 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LcatP16301 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LcatP16301 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LcatP16301 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LcatP16301 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LcatP16301 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LcatP16301 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LcatP16301 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LcatP16301 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LcatP16301 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LcatP16301 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LcatP16301 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LcatP16301 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LcatP16301 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LcatP16301 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LcatP16301 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LcatP16301 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LcatP16301 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LcatP16301 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LcatP16301 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LcatP16301 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LcatP16301 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LcatP16301 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LcatP16301 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LcatP16301 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LcatP16301 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LcatP16301 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LcatP16301 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LcatP16301 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LcatP16301 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LcatP16301 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LcatP16301 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LcatP16301 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LcatP16301 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LcatP16301 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LcatP16301 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LcatP16301 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LcatP16301 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LcatP16301 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LcatP16301 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LcatP16301 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LcatP16301 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LcatP16301 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LcatP16301 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LcatP16301 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LcatP16301 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LcatP16301 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LcatP16301 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcatP16301 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcatP16301 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcatP16301 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcatP16301 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcatP16301 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcatP16301 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcatP16301 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LcatP16301 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LcatP16301 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LcatP16301 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LcatP16301 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LcatP16301 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LcatP16301 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LcatP16301 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LcatP16301 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LcatP16301 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LcatP16301 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LcatP16301 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LcatP16301 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LcatP16301 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LcatP16301 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LcatP16301 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LcatP16301 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms