Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnc1P15388 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnc1P15388 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnc1P15388 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnc1P15388 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnc1P15388 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1185.4 ms