Protein–RNA interactions for Protein: P15209

Ntrk2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk2P15209 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ntrk2P15209 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ntrk2P15209 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ntrk2P15209 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms