Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-D1P14427 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-D1P14427 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-D1P14427 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms