Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrgnP13609 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrgnP13609 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrgnP13609 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrgnP13609 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrgnP13609 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrgnP13609 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrgnP13609 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SrgnP13609 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrgnP13609 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrgnP13609 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrgnP13609 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrgnP13609 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrgnP13609 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrgnP13609 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms