Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OtcP11725 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OtcP11725 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OtcP11725 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OtcP11725 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OtcP11725 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OtcP11725 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OtcP11725 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OtcP11725 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OtcP11725 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OtcP11725 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OtcP11725 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OtcP11725 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OtcP11725 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OtcP11725 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OtcP11725 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
OtcP11725 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OtcP11725 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OtcP11725 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OtcP11725 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
OtcP11725 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OtcP11725 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OtcP11725 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtcP11725 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtcP11725 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtcP11725 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OtcP11725 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtcP11725 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OtcP11725 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtcP11725 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtcP11725 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtcP11725 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtcP11725 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtcP11725 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OtcP11725 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
OtcP11725 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtcP11725 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtcP11725 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtcP11725 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtcP11725 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtcP11725 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtcP11725 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OtcP11725 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OtcP11725 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OtcP11725 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OtcP11725 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OtcP11725 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtcP11725 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtcP11725 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtcP11725 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtcP11725 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OtcP11725 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OtcP11725 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OtcP11725 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OtcP11725 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OtcP11725 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OtcP11725 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OtcP11725 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OtcP11725 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtcP11725 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtcP11725 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtcP11725 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtcP11725 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtcP11725 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtcP11725 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtcP11725 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OtcP11725 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OtcP11725 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OtcP11725 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
OtcP11725 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OtcP11725 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
OtcP11725 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtcP11725 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtcP11725 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtcP11725 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OtcP11725 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtcP11725 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtcP11725 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtcP11725 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtcP11725 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OtcP11725 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtcP11725 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OtcP11725 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtcP11725 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtcP11725 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OtcP11725 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtcP11725 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtcP11725 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OtcP11725 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms