Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa1P11477 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa1P11477 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa1P11477 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa1P11477 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa1P11477 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa1P11477 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa1P11477 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa1P11477 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms