Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lamp1P11438 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lamp1P11438 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lamp1P11438 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lamp1P11438 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lamp1P11438 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms