Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FlgP11088 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FlgP11088 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FlgP11088 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FlgP11088 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FlgP11088 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FlgP11088 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FlgP11088 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FlgP11088 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FlgP11088 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FlgP11088 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FlgP11088 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FlgP11088 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FlgP11088 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FlgP11088 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FlgP11088 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FlgP11088 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FlgP11088 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FlgP11088 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FlgP11088 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FlgP11088 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FlgP11088 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FlgP11088 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FlgP11088 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FlgP11088 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FlgP11088 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FlgP11088 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FlgP11088 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FlgP11088 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FlgP11088 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FlgP11088 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FlgP11088 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FlgP11088 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FlgP11088 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FlgP11088 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FlgP11088 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FlgP11088 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FlgP11088 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FlgP11088 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FlgP11088 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FlgP11088 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FlgP11088 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FlgP11088 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FlgP11088 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FlgP11088 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FlgP11088 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FlgP11088 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FlgP11088 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FlgP11088 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FlgP11088 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FlgP11088 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FlgP11088 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FlgP11088 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FlgP11088 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FlgP11088 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FlgP11088 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FlgP11088 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FlgP11088 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FlgP11088 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FlgP11088 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FlgP11088 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FlgP11088 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FlgP11088 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FlgP11088 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FlgP11088 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FlgP11088 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FlgP11088 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FlgP11088 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FlgP11088 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FlgP11088 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FlgP11088 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FlgP11088 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FlgP11088 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FlgP11088 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FlgP11088 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FlgP11088 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FlgP11088 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FlgP11088 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FlgP11088 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FlgP11088 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FlgP11088 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FlgP11088 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FlgP11088 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FlgP11088 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FlgP11088 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FlgP11088 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FlgP11088 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FlgP11088 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FlgP11088 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FlgP11088 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FlgP11088 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FlgP11088 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FlgP11088 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FlgP11088 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FlgP11088 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FlgP11088 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FlgP11088 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FlgP11088 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FlgP11088 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FlgP11088 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms